代谢综合征目前引起广泛关注主要因为其下述几个特点。首先，几种“代谢”因素相互关联、相互影响，而不能单纯永偶然事件来解释。其次，这些因素本身及各种组合方式的出现均与心血管疾病和糖尿病的发生有关。再次，就代谢综合征本身而言尚无明确的治疗方法，治疗上应采用个体化方案，根据患者存在的危险因素进行相应治疗。但生活方式干预适用于所有患者。最后，尽管已有相当数量的文献报道，关于代谢综合征的研究尚不完善。
目前存在的主要问题有以下几点。首先代谢综合征的诊断标准缺乏生物学依据。目前的标准对诊断的灵敏性、特异性和阳性预期值均缺乏明确说明，甚至也没有证据显示为何应用这个标准来诊断代谢综合征，如为何血压的切点定为130/80 mmHg，而不是其他如135/80 mmHg 或130/75mmHg。其次，代谢综合征不能很好的预期心血管疾病或糖尿病的发生。不可否认代谢综合征与心血管疾病或糖尿病的发生有相关性，因其诊断标准中含有2个主要的糖尿病危险因素，肥胖和糖耐量异常，以及5个心血管疾病危险因子。应用“代谢综合征”这一概念的目的在于辨别处于心血管疾病或糖尿病远期高危状态的个体，但绝大多数关于代谢综合征的报道其研究年限小于10年，且无证据显示应用代谢综合征诊断标准比单纯应用血糖值更能精确预测糖尿病的发生。再次，无证据显示将患者诊断为代谢综合征比仅了解患者存在一系列代谢异常能给临床医师提供更多信息。另外，代谢综合征的临床意义不大。告诉病人还有代谢综合征并不比告诉其有一系列心血管疾病危险因子更能影响其长期生活方式的调整。最后，给患者带上代谢综合征的“帽子”兑换这和临床医师都会产生一定的误导。目前的诊断标准各项目只有下限切点而没有分度，这就造成例如一个轻度肥胖、空腹血糖105 mg/dl、收缩压130 mmHg的患者与一个严重超重、 未控制糖尿病、收缩压160 mmHg的患者均诊断为代谢综合征而不能分别区分其发生心血管疾病和糖尿病的危险度。
综上所述，代谢综合征因自身具有多种不确定因素，其临床存在价值只得进一步商榷。事实上，尽管代谢综合征对医疗保健有一定的指导意义，但其极易误导医疗工作，误导患者，造成不必要的医疗支出。我们已经有较为完善的针对心血管疾病和糖尿病的医学指南和治疗方案，生活方式干预是治疗的基础和关键。在医疗实践中将这一诊疗系统复杂化应该是没有必要甚至是无益的。
